Download Descarga

Survey
yes no Was this document useful for you?
   Thank you for your participation!

* Your assessment is very important for improving the work of artificial intelligence, which forms the content of this project

Document related concepts

Péptido wikipedia, lookup

Estructura de las proteínas wikipedia, lookup

Aminoacil ARNt sintetasa wikipedia, lookup

Biosíntesis proteica wikipedia, lookup

Proteína wikipedia, lookup

Transcript
Curso de Biocatálisis
(Proteómica y enzimología)
Día 2
Yuri Peña
Campeche, Campeche
julio de 2016
proteína.
(Del fr. protéine, y
este del gr. πρωτεῖος, preeminente, de
primera calidad, e -ine, -ina).
1. f. Sustancia constitutiva de la materia
viva, formada por una o varias cadenas
de aminoácidos
Aminoácidos
La caja bioquímica de herramientas
20 herramientas distintas
Aminoácidos alifáticos no polares
Aminoácidos aromáticos
Aminoácidos polares sin carga
Aminoácidos con carga positiva
Aminoácidos con carga negativa
La estructura y las propiedades permiten la función:
1
2
( ) Apretar / aflojar tuercas
( ) Apretar / aflojar
tornillos
( ) Perforar
( ) Recoger material
3
4
( ) Golpear, romper
5
La estructura y las propiedades permiten la función:
1. Aminoácidos no polares
alifáticos
( ) Trabajan con moléculas
negativas
2. Aminoácidos aromáticos
( ) Trabajan con moléculas
que aceptan o ceden
electrones
3. Aminoácidos polares no
cargados
4. Aminoácidos cargados
positivamente
5. Aminoácidos cargados
negativamente
( ) Trabajan con moléculas
positivas
( ) Trabajan con moléculas
hidrofóbicas
( ) Trabajan con moléculas
hidrofílicas
Un cinturón de herramientas bioquímicas
El enlace peptídico
Un cinturón de herramientas bioquímicas
Las proteínas!!!
Un cinturón de herramientas:
Péptidos y proteínas
La representación de los péptidos y proteínas puede
hacerse mediante la escritura del código de cada
aminoácido de acuerdo a la secuencia de ellos en la
cadena.
Ejemplo:
Un tripéptido de Glicina: GGG
Un decapéptido de Alanina y Prolina: APAPAPAPAP
Péptidos y proteínas. Posibilidades infinitas
Cuántos péptidos distintos podrían obtenerse para un
dipéptido? R = 202 =400
Y para un tripéptido? R= 203 =8000
Y para una proteína de 100 aminoácidos de largo?
R= 20100 = 1.26130 = 126765060022823000000000000000000000000000
00000000000000000000000000000000000000000
00000000000000000000000000000000000000000
0000000
Números astronómicos!
El universo conocido se estima que tiene 1080 núcleos de protones ó 1080 Daltones
Si multiplicamos la masa de una proteína promedio de 100 aminoácidos (≈13,800
Daltones) por las distintas probabilidades, obtenemos 1.75134 Daltones.
Necesitaríamos 1054 universos para tener la materia necesaria para construir cada
combinación única.
Diversidad en tamaño de las proteínas
Proteína
Insulina
Número de Aminoácidos
Peso Molecular (Da)
47
5733
Citocromo
103
12500
Ribonucleasa A
104
12640
Lisosima
115
13930
Mioglobina
140
16980
Quimiotripsina
187
22600
Hemoglobina
533
64500
Albúmina sérica
566
68500
Hexocinasa
790
96000
Gamma globulina
1239
149900
Glutamato deshidrogenasa
2750
332694
Miosina
3884
470000
Ribulosa bifosfato carboxilasa
4628
560000
Glutamino sintetasa
4959
600000
31539
3,816,188
Taitina
Cn3D
Estructura tridimensional de las proteínas
Actividad:
Escribe tu nombre en código genético. Cambia las B por V; las J por G; las Ñ por N; las O por Q; las U por V y las W, X y Z por N.

SECUENCIA de aminoácidos

PLEGAMIENTOS locales

PLEGAMIENTOS locales

PLEGAMIENTOS del péptido completo

PLEGAMIENTOS del péptido completo

Estructura de polipéptidos
Plegamiento de proteínas
Enzimas
Reacción química
Reacción bioquímica (catalizada por una enzima)
Las enzimas aceleran reacciones químicas
Las enzimas son muy procesivas
Catalasa
H2O2 H2O + ½ O2